Vybavení a potřeby Dendro

• Excentrická bruska ( Bosch , DeWalt )

•   Pásová bruska ( Makita )

• Brusné kotouče a pásy (Klingspor)

• Elektrický ruční hoblík ( Bosch )

• Držáky jádra

• Tužky s jemným hrotem

• Nástroj Dremel

• Stereo mikroskop

  • Mikroskopy AmScope jsou kvalitní za dobrou cenu.

  • Leica a Olympus jsou pár prémiových značek.

  • Omano, Meiji, Motic a další najdete na Microscope.com

• Stojan na mikroskop s výložníkem

  • Stojany lze nalézt prostřednictvím Amscope atd. Zajistěte kompatibilitu s vaším mikroskopem!

• Mikroskopická kamera

  • Mezi značkami najdeme i fotoaparáty.

• Světelný zdroj (iluminátor) pro mikroskopii

  • Mnoho různých značek a typů světelných zdrojů

• LinTab Modular Tree-Ring Measuring Stage (Rinntech)

• Systém měření letokruhů Velmex (Velmex Inc.)

• Změřte J2X Program měření letokruhů (VoorTech Consulting) pracuje v tandemu se systémem měření letokruhů Velmex (Velmex Inc.)

• CooRecorder pro měření naskenovaných letokruhů (Cybis Dendrochronology)

• CDendro pro statistické křížení (Cybis Dendrochronology)

• WinDENDRO letokruhy a hustota dřeva (Regent Instruments Inc.)

• WinCELL je softwarový program pro analýzu obrazu speciálně navržený pro analýzu dřevěných buněk. Dokáže kvantifikovat změny ve struktuře dřeva přes letokruhy.

• TSAP-Win je software používaný k analýze letokruhů a může pracovat s měřicími stupni LinTab a LignoVision . (Rinntech)

• Tellervo je systém pro měření, správu a ošetřování dendrochronologických vzorků. Je to bezplatný a open source software

• Nástroj pro analýzu obrazu ROXAS pro kvantifikaci anatomie xylému (WSL)

• ImageJ pro buněčné zpracování a analýzu obrazu

• TRiCYCLE je univerzální podpora převodníku dat dendro, která dokáže převádět mezi libovolnou kombinací 22 různých datových formátů

• Další dendrochronologické programy lze nalézt a stáhnout ze stránky "Software" Tree Ring Lab | Columbia Climate School of Lamont-Doherty Earth Observatory . Patří mezi ně běžně používané „ARSTAN“, „Cofeche“, „Edrm“ a další.

• Program R a balíčky přidružené k dendrochronologii (viz níže)

• FHAES analyzuje chronologie událostí, jako jsou ty ze stromů zjizvených ohněm, ale může být také použit k analýze chronologie jiných rušivých událostí, jako jsou laviny, povodně, zamrznutí nebo napadení hmyzem.

• Balíček dplR : The Dendrochronology Program Library in R (dplR)

  • dplR je softwarový balík ve statistickém programovacím prostředí R pro stromové analýzy. R je přední světové statistické výpočetní prostředí s otevřeným zdrojovým kódem, kam mohou uživatelé přispívat balíčky, které jsou volně dostupné na internetu. dplR umí číst soubory standardního formátu a provádět několik standardních analýz. Patří mezi ně interaktivní detrendování, vytváření chronologie a výpočet standardních popisných statistik. Balíček může také vytvářet různé grafy v kvalitě publikace. - Dr. Andy Bunn (GitHub)

• Aplikace xDateR – Dr. Andy Bunn

• DendrTools package : Lineární a nelineární metody pro analýzu denních a měsíčních dendroklimatologických dat

  • Poskytuje nové dendroklimatologické metody, primárně používané komunitou pro výzkum letokruhů. Existují čtyři základní funkce. První z nich je daily_response(), která najde optimální sekvenci dní, které se vztahují k jednomu nebo více stromovým proxy záznamům. Podobnou funkcí je daily_response_seascorr(), která implementuje dílčí korelace do analýzy funkcí denní odezvy. Pro nadšence měsíčních dat je tu funkce month_response(). Poslední základní funkcí je Compare_methods(), která efektivně porovnává několik lineárních a nelineárních regresních algoritmů na úloze rekonstrukce klimatu. - Dr. Jernej Jevsenak (GitHub)

• Epson Perfection V600 (Amazon)

• Epson Perfection V850 Pro (Amazon)

• Širokoformátový skener Epson Expression 10000XL (Amazon)

• Plochý skener Epson Expression 12000XL-GA (Amazon)

• Microtomes od WSL Švýcarsko

  • Technická perspektiva v moderním výzkumu letokruhů – ukázka a informace o používání mikrotomů – WSL (YouTube)

• Hmotnostní spektrometry s izotopovým poměrem Sercon, systémy pro přípravu vzorků, spotřební materiál

  • Společnost Sercon se věnuje návrhu, výrobě a podpoře izotopových poměrových hmotnostních spektrometrů a jejich souvisejících systémů pro přípravu vzorků.

​

•  The easyclimate R package: easy access to high-resolution daily climate data for Europe 

• sgsR - structurally guided sampling (R package)

  • sgsR is designed to implement structurally guided sampling approaches for enhanced forest inventories. The package was designed to function using rasterized airborne laser scanning (ALS; Lidar) metrics to allow for stratification of forested areas based on structure.

• TALLO - A global tree allometry and crown architecture database

  • TALLO GitHub

  • This is the repository of the Tallo database, a global collection of georeferenced and taxonomically standardized records of individual trees for which stem diameter, height and/or crown radius have been measured.

  • For a full description of the database, see: Jucker et al. (2022). Tallo - a global tree allometry and crown architecture database. Global Change Biology, doi:10.1111/GCB.16302 (https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/gcb.16302).

• Smartphone Apps for Field Research Compiled by the Bruna Lab - University of Florida

  • https://github.com/BrunaLab/apps_for_fieldwork/blob/main/index.Rmd